Après avoir défait le tyran Freezer puis quitté la planète Namek avant sa destruction, Goku et ses amis font la connaissance des terribles cyborgs et de Cell, l'ultime guerrier créé par le revanchard Dr. Gero à partir des cellules de nos héros. Cell est bien décidé à défier et à éliminer le groupe de saiyajin. Pour accomplir son plan, il organise donc un grand tournoi auquel il convie ses dignes adversaires. Une fois encore, le sort de la Terre est en jeu.

Cette suite à Super Butouden possède également un mode Histoire qui débute cette fois à la préparation du Cell Game. Vous aurez donc le choix parmi quatre des dix personnages du jeu pour espérer vaincre Cell dans ce mode (Gohan, Piccolo, Vegeta ou Trunks). Mais en plus du chapitre consacré au Cell Game, deux autres font intervenir respectivement les très appréciés Bojack et Broly. Une excellente surprise à l'époque pour les nombreux fans de l'invincible et ultra bodybuildé, mais néanmoins complètement barré, guerrier millénaire.